حجت الاسلام والمسلمین محمدعلی خسروی، آیت الله سید مصطفی خمینی را شخصی ذوابعاد دانست که در علوم مختلف حوزوی متخصص بود. وی درباره شخصیت قرآنی و تفسیری و بخصوص تفسیر القرآن الکریم ایشان نیز مطالبی را بیان کرد.